دانلود,رایگان,پایان نامه,پروژه,مقاله,مقالات, تحقیق آماده, پاورپوینت
دانلود,رایگان,پایان نامه,پروژه,مقاله,مقالات, تحقیق آماده, پاورپوینت,دانلود گزارش کارآموزی,, دانلود پروژه دانشجویی, دانلود تحقیق رایگاندانلود,رایگان,پایان نامه,پروژه,مقاله,مقالات, تحقیق آماده, پاورپوینت
دانلود,رایگان,پایان نامه,پروژه,مقاله,مقالات, تحقیق آماده, پاورپوینت,دانلود گزارش کارآموزی,, دانلود پروژه دانشجویی, دانلود تحقیق رایگاندانلود دانلود پاورپوینت خلاصه سازی متن
دانلود پاورپوینت خلاصه سازی متن
دانلود پاورپوینت خلاصه سازی متن - خلاصه سازی متن تاریخچه شروع خلاصه سازی متن به سال 1950 برمی گردد. به دلیل کمبود کامپیوترهای قدرتمند و مشک...
دانلود دانلود پاورپوینت ذخیره سازی ، بازیابی اطلاعات و
دانلود پاورپوینت ذخیره سازی ، بازیابی اطلاعات و
دانلود پاورپوینت ذخیره سازی , بازیابی اطلاعات و - بنام خدا ذخیره سازی ذخیره سازی ، بازیابی اطلاعات و مهندسی فایلها دراین مجموعه داریم: دسته...
دانلود دانلود پاورپوینت ذخیره سازی ، بازیابی اطلاعات ومهندسی فایلها
دانلود پاورپوینت ذخیره سازی ، بازیابی اطلاعات ومهندسی فایلها
دانلود پاورپوینت ذخیره سازی , بازیابی اطلاعات ومهندسی فایلها - بنام خدا ذخیره سازی ، بازیابی اطلاعات و مهندسی فایلها دراین مجموعه داریم: دست...
دانلود دانلود پاورپوینت پیاده سازی رویکرد شش سیگما(مراحل اندازه گیری)
دانلود پاورپوینت پیاده سازی رویکرد شش سیگما(مراحل اندازه گیری)
دانلود پاورپوینت پیاده سازی رویکرد شش سیگما(مراحل اندازه گیری) - بنام خداوند جان و خرد پیاده سازی رویکرد شش سیگما(مراحل اندازه گیری) بنام خداو...
دانلود دانلود پاورپوینت پیاده سازی رویکرد شش سیگما(اندازه گیری)
دانلود پاورپوینت پیاده سازی رویکرد شش سیگما(اندازه گیری)
دانلود پاورپوینت پیاده سازی رویکرد شش سیگما(اندازه گیری) - مرحله اندازه گیری (measure) بنام خداوند جان و خرد پیاده سازی رویکرد شش سیگما( انداز...
دانلود دانلود پاورپوینت پیاده سازی رویکرد شش سیگما
دانلود پاورپوینت پیاده سازی رویکرد شش سیگما
دانلود پاورپوینت پیاده سازی رویکرد شش سیگما - مرحله اندازه گیری (measure) بنام خداوند جان و خرد پیاده سازی رویکرد شش سیگما بنام خداوند جان و ...
دانلود دانلود پاورپوینت مجموعه سازی
دانلود پاورپوینت مجموعه سازی
دانلود پاورپوینت مجموعه سازی - مجموعه سازی 1 طرح کلی درس دانشجو در این درس بطور کلی با مجموعه سازی، فراهم آوری و سیاست های انتخاب انواع مواد ...
دانلود دانلود پاورپوینت فعالیت های بهینه سازی مصرف انرژی در نیروگاههای کشور
دانلود پاورپوینت فعالیت های بهینه سازی مصرف انرژی در نیروگاههای کشور
دانلود پاورپوینت فعالیت های بهینه سازی مصرف انرژی در نیروگاههای کشور - فعالیت های بهینه سازی مصرف انرژی در نیروگاههای کشور 1- نیروگاه حرارتی شه...
دانلود دانلود پاورپوینت SEO بهینه سازی سایت
دانلود پاورپوینت SEO بهینه سازی سایت
دانلود پاورپوینت SEO بهینه سازی سایت - بسم الله الرحمن الرحیم موضوع ارائه : SEO (بهینه سازی سایت) تعریف SEO رتبه گذاری و Page Rank تاثیر SEO...
دانلود دانلود مقاله در مورد شبیه سازی مولکولی
دانلود مقاله در مورد شبیه سازی مولکولی
فرمت فایل دانلودی: .zipفرمت فایل اصلی: .doc
تعداد صفحات: 41
حجم فایل: 77 کیلوبایت
قیمت: 6000 تومان
لینک دانلود و خرید پایین توضیحات
دسته بندی : وورد
نوع فایل : word (..doc) ( قابل ویرایش و آماده پرینت )
تعداد صفحه : 41 صفحه
قسمتی از متن word (..doc) :
2
مبانی شبیه سازی دینامیک مولکولی
شبیه سازی مولکولی به روشهایی گفته میشود که با در نظر گرفتن مولکولهای یک سیستم و مدل بر هم کنش آنها و محاسبه موقعیتها و سرعتهای آن ذرات در هر لحظه از زمان و استفاده از روابط مکانیک آماری خواص ماکروسکوپی سیستم را محاسبه میکند. شبیه سازیهای کامپیوتری نقش ارزشمندی در پاسخ دقیق به مسائل آماری دارند که فقط بوسیله روشهای تقریبی قابل حل هستند. بدین ترتیب شبیه سازی کامپیوتری روشی برای آزمایش نظریههای مختلف مکانیک آماری است علاوه بر این نتایج شبیه سازیهای کامپیوتری را میتوان در حد نتایج آزمایشهای واقعی دانست.
روش شبیه سازی ملکولی به عوض تلاشی جهت استنتاج رفتار میکروسکوپی از مشاهدات آزمایشگاهی، دیدگاه سازندهای را دنبال میکند که در آن سعی میشود با استفاده از سیستمهای مدل رفتار میکروسکوپی بازسازی شود. بدین ترتیب این گونه روشها میتوانند به منظور آزمایش مدلهای ارائه شده مولکولی به کار روند و یا با استفاده از مدلهای تایید شده برای محاسبه خواص مدل مورد استفاده قرار گیرند. این نقش دوگانه شبیه سازی به صورت پلی میان مدلها و پیش بینیهای نظری از یک سو و مدلها و نتایج آزمایشگاهی از سوی دیگر است. تفاوت بین شبیه سازی کامپیوتری و سایر محاسبات در نحوه استفاده از کامپیوتر است. در شبیه سازی، کامپیوتر تنها یک محاسبهگر نیست بلکه آزمایشگاهی مجازی که در آن یک سیستم بررسی میشود .
شکل 2- 1- صفحه 5 کتاب آن
به همین دلیل از تکنیکهای شبیه سازی کامپیوتری به عنوان آزمایشهای کامپیوتری نیز یاد میشود. شبیه سازی کامپیوتری ارتباط مستقیمی بین جزئیات میکروسکوپی یک سیستم (جرم اتمها، بر هم کنشهای بین آنها، شکل هندسی مولکولها و .....) و خواص ماکروسکوپی قابل اندازهگیری (معادله حالت، ضرایب انتقالی، پارامترهای نظم ساختاری و ....) برقرار میسازد که این کمیتها علاوه بر اهمیت آکادمیک در صنعت نیز از اهمیت خاصی برخوردار میباشند. انجام این آزمایشات تحت شرایط دما و فشار بسیار بالا میتواند با دشواری همراه باشد. در صورتی که انجام این گونه آزمایشات بوسیله شبیه ساز کامپیوتری کار بسیار سادهتری است. تعیین جزئیات ساختار و حرکت مولکولها به عنوان مثال در واکنشهای کاتالیستی ناهمگن، انتقال یون سریع یا واکنشهای آنزیمی بوسیله روشهای آزمایشگاهی بسیار سخت است در حالی که به سادگی میتوان این نتایج را از شبیه سازی کامپیوتری استخراج نمود. سرعت زیاد بعضی از رخدادها در واکنش
2
مبانی شبیه سازی دینامیک مولکولی
ها یا سیستمهای شیمیایی هر چند که تشخیص آزمایشگاهی آنها را با مشکل روبرو میکند. در شبیه سازی مولکول یک نقطه سادگی محسوب میگردد. یعنی رخدادهایی با سرعت بیشتر با سهولت بیشتری شبیه سازی میگردد. گستره وسیعی از پدیدههای میتواند بوسیله شبیه سازی کامپیوتری مورد مطالعه قرار گیرد.
3- 1- شبیه سازی تعیینی و تصادفی
یک شبیه سازی در مقیاس مولکولی از سه قسمت اصلی تشکیل شده است:
الف) ساختن مدل مولکولی
ب) محاسبه مسیرهای مولکولی
ج) تجزیه و تحلیل این مسیرها برای بدست آوردن مقادیر عددی خواص مورد نظر
وظیفه واقعی شبیه سازی مولکولی قسمت دوم است. بر اساس شیوه محاسبه موقعیتهای مولکولی rN در قسمت دوم میتوان روشهای شبیه سازی را از هم تفکیک نمود. روشهای شبیه سازی دینامیک مولکولی بر پایه حل معادلات حرکت مولکولی به منظور تولید پیکربندیهای جدید استوار میباشد در نتیجه شبیه سازیهای دینامیک مولکولی را میتوان برای بدست آوردن خواص وابسته به زمان مورد استفاده قرار داد. در حالی که روش مونت کارلو بر پایه احتمالات است. بدین صورت که یک پیکربندی آزمایشی بطور تصادفی تولید میگردد. سپس این پیکربندی سیستم بوسیله معیارهایی برای مقبولیت یا عدم مقبولیت آن بوسیله محاسبه تغییر انرژی و خواص دیگر در پیکربندی آزمایشی ارزیابی میگردد. و سرانجام با مقایسه کل پیکربندیهای تولید شده و پیکربندیهای پذیرفته شده یا رد شده و استفاده از میانگین گیرهای مجموعهای خواص مولکولی محاسبه میگردد.
در بعضی روشهای دیگر موقعیتها با استفاده از یک روش ترکیبی بدست میآید. به گونهای که مانند روش مونت کارلو تا حدی بصورت تصادفی است و از طرف دیگر مانند MD دارای خاصیت تعیینی است. روشهای مختلف را میتوان بر اساس میزان خاصیت «تعیینی» آنها در تولید موقعیتهای مولکولی به صورت زیر مرتب کرد.
شکل صفحه 19- پایان نامه دکتر یگانگی
در شبیه سازی دینامیک مولکولی، موقعیتهای مولکولی rN از حل عددی معادلات حرکت بدست میآیند. بنابراین موقعیتها از نظر زمانی به همدیگر متصل هستند. در روشهای دیگر شبیه سازی موقعیتهای مولکولی از نظر زمانی به یکدیگر وابسته نیستند. به عنوان مثال در شبیه سازی
3
مبانی شبیه سازی دینامیک مولکولی
«مونت کارلو» Monte Carlo
موقعیتها به صورت تصادفی تولید میشوند به طوری که ساختاری مولکولی rN فقط به ساختار قبلی بستگی دارد. وقتی که نتیجه یک واقعه تصادفی در یک رشته فقط به نتیجه واقعه قبلی بستگی داشته باشد به آن رشته یک «زنجیر مارکوف» میگویند. در بعضی روشهای دیگر موقعیتها با استفاده از یک روش ترکیبی بدست میآید. به گونهای که مانند روش مونت کارلو تا حدی به صورت تصادفی است و از طرف دیگر مانند MD دارای خاصیت تعیینی است. روشهای مختلف را میتوان بر اساس میزان خاصیت «تعیینی» آنها در تولید موقعیتهای مولکولی به صورت زیر مرتب کرد.
«تعیینی» «تصادفی»
دینامیک دینامیک دینامیک مونت کارلو مونت کارلو
مولکولی عمومی لاگرانژی براونی Force Biased مترو پولیس
شکل (2- 1)- درجه نسبی تعیینی در روشهای مختلف شبیه سازی مولکولی [34]
2- 3- 1- شبیه سازی مونت کارلو MC
روش تصادفی خالص مونت کارلو به سیستم با تعداد مولکول ثابت N در حجم ثابت V که در دمای ثابت T نگه داشته میشود، صورت میگیرد. فرآیند شبیه سازی از روش عمومی مونت کارلو برای محاسبه انتگرالهای چند بعدی استخراج شده است. انتگرالها در اینجا متوسطهای مکانیک آماری روی.
در زیر الگوریتم کلی برای روش مونت کارلو و دینامیک مولکولی ارائه گردیده است.
الگوریتم 1-1- قسمتهای اصلی شبیه سازی مونت کارلو
تولید یک پیکربندی اولیه: قسمت اول
تولید یک زنجیره مارکوف برای چرخهها: قسمت دوم
تعداد چرخهها N 1000 ← i: LOOP
یک پیکر بندی جدید تولید کن
احتمال انتقال از حالت اولیه به این پیکربندی تصادفی را تعیین کن W
یک عدد تصادفی بین 1 تا صفر را انتخاب کن R
If (W> R) then
4
مبانی شبیه سازی دینامیک مولکولی
حرکت مورد قبول است
Else
حرکت مردود است
End if
End LOOP
الگوریتم 2- 1- قسمتهای اصلی دینامیک مولکولی
تولید یک پیکربندی اولیه: قسمت اول
شبیه سازی به مدت tMax: قسمت دوم
LOOP
یک پیکربندی جدید توسط حل معادلات حرکت تولید کن
بوسیله میانگین گیری زمانی کمیتهای مورد نظر را محاسبه کند
(time ≥ t Max) در حالی که
3- 2- مدل شبیه سازی
به منظور شبیه سازی یک سیستم مولکولی ابتدا باید از بر هم کنش بین ذرات آن سیستم و بر هم کنس بین ذرات و محیط اطلاعات صحیح در دسترس باشد. برای بدست آوردن این اطلاعات از یک مدل استفاده میشود. این مدل شامل یک انرژی پتانسیل بین مولکولی یا معادل آن تابع نیروی بین مولکولی است. بطور کلی میتوان انرژی پتانسیل یک سیستم متشکل از N اتم را به صورت مجموع جملاتی متشکل از پتانسیل ذرات انفرادی، جفتی، سه تایی و غیره به صورت رابطه ( ) در نظر گرفت.
(1- 4)
که در آن دلالت بر جمع روی همه جفت ذرات j, I بدون احتساب جملات تکراری دارد. اولین جمله در معادله (1- 4) u1 (ri) اثر یک میدان خارجی بطور مثال دیوارههای ظرف روی سیستم را نشان میدهد. بقیه جملات به بر هم کنشهای ذرات میپردازند. بر اساس این جداسازی بر هم کنش بین مولکول و بر هم کنش سیستم محیط مستقل از هم هستند. جمله دوم u2، پتانسیل جفتی مهم در این جمله است پتانسیل جفتی فقط به اندازه جدایی بین ذرات rij = | ri – rj
پرداخت با کلیه کارتهای عضو شتاب امکان پذیر است.